在“整合的”分子和组织学诊断指南引入之前，弥漫性神经胶质瘤根据组织学被分为以下类别之一 :星形细胞瘤、少突胶质细胞瘤或混合型胶质细胞瘤。除了组织学类型，肿瘤被(现在仍然)分级为世界卫生组织二级、三级和四级，它们被认为是预测肿瘤侵袭性和患者生存率的基础。三级的标准是增加“间变性”特征，如增加细胞密度、有丝分裂和核间变性。四级(胶质母细胞瘤)的标准是微血管增生和/或肿瘤坏死，以及间变性特征。因此，2016年之前的世卫组织标准存在很大的主观性和可变解释空间，包括没有区分二级和三级的截止标准。此外，弥漫性胶质瘤的特征之一是瘤内组织学的高度异质性。后者对于高级别胶质瘤(三级或四级)尤其如此，将肿瘤取样作为另一个影响可变读数的因素。这一方案的挑战和局限性反映在“具有少突胶质成分的GBM”和“混合少突胶质细胞瘤”等亚类中，这些亚类在2016年前的弥漫性胶质瘤诊断中占很大比例。
2016年世卫组织更新将组织学与肿瘤遗传信息相结合，以创建特定的诊断算法。一 首先，组织学信息用于鉴别弥漫性神经胶质瘤/肿瘤分级。然后，检测IDH突变状态，首先通过免疫组织化学(IHC)检测IDH1 R132H(所有IDH突变的90%)，可获得突变特异性抗体。如果肿瘤对IDH1 R132H呈阴性，则需要测序以鉴定其他微小的IDH1/IDH2突变(∊10%)。对于55岁以上的GBM患者，不建议测序，因为在该组中检测其他IDH突变的概率非常低。
对于IDH突变的低级胶质瘤(二级和三级)，一组遗传参数可以区分星形细胞瘤和少突胶质细胞瘤。对于少突胶质细胞瘤(均为IDH突变)，需要证明由于染色体臂1p和19q缺失(1p19q codel)导致的杂合性缺失。1p19q编码是不平衡的全臂染色体易位(伴随衍生染色体丢失)t(1p；19q)并且是少突胶质细胞瘤的分子标志。荧光原位杂交(FISH)是测定1p19q codel最常用的技术，但也可以使用其他杂合性缺失测定技术(一种检测全臂缺失的方法)(见下文)。
相反，IDH突变型星形细胞瘤(占所有星形细胞瘤的80%)是由ATRX和TP53突变(缺乏1p19q codel)定义的。少突胶质细胞瘤中不存在ATRX和TP53突变。对于缺乏IDH突变的低级别胶质瘤，无论是通过IHC还是测序(20%的星形细胞瘤)，IDH-野生型星形细胞瘤的诊断得以确立。
对于GBM，IDH突变状态由IHC确定(如果IHC在患者中为阴性，则进行测序%3C55年)。尽管大多数转基因生物是IDH野生型，但5%至15%的转基因生物是IDH突变型。大多数IDH突变型胶质母细胞瘤是“继发性”胶质母细胞瘤，这意味着大多数有证据表明从以前的低级胶质细胞瘤发展而来。大多数IDH野生型GBM是“初级”GBM，这意味着它们是重新出现的。如下所述，两类星形细胞瘤(“IDH突变型”和“IDH野生型”)和胶质母细胞瘤具有不同的遗传和临床特征。
新的综合诊断的一个重要贡献是消除了混合少星形细胞瘤类别。 这是一个结合分子参数如何解决神经病理学中经常遇到的诊断难题的例子。没有谱系特异性免疫组织化学标记可用于区分星形细胞瘤和少突胶质细胞瘤；因此，肿瘤分型依赖于给定胶质瘤中星形胶质细胞或少突胶质细胞成分的形态学鉴定。重要的是，基于ATRX和TP53突变和1p19q codel分别作为星形细胞瘤和少突胶质细胞瘤的特征谱系标记的新综合诊断显示，这两个参数是互斥，从而完全消除了混合少星形细胞瘤的范畴。在形态学和遗传参数不匹配的情况下(即形态学提示一种类型，但分子参数指向另一种类型)，最终的综合诊断将依赖于分子决定簇。
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