胶质瘤的手术有两个关键因素：一：可以明确病理胶质瘤诊断以及分子特征，为后续的治疗提供指导；二：通过切除肿瘤，使得脑组织不再受压迫以及颅内的压力恢复正常，并为后续可能的治疗打下基础。
胶质瘤切除越完全，治疗的效果也就越好，但是由于胶质瘤位于脑组织这样一个不同的部位，不能把周围肿瘤侵犯的脑组织无限制的切除，造成严重的功能损害甚至是死亡，只能是在较大水平保护病人功能和顺利的情况下较大水平的切除肿瘤。而胶质瘤手术切除中在保护病人功能和顺利以及切除肿瘤之间选择合适的平衡点，则是对神经外科医生技术和能力的较大挑战。
神经外科医生需要根据胶质瘤的位置、大小、可能的病理性质，选择较合适的切除方式。
对于位于额较、颞较以及枕较的胶质瘤，脑叶切除术是较完全的手术切除方式，也就是切除术前影像学上的肿瘤及其周边可能侵犯的脑组织，一直到周围正常的硬脑膜颅骨等结构。因为胶质瘤是生长在脑组织内的，切除到了这些部位后，这些位置已经只剩下空腔而没有脑组织了，所以也就不存在胶质瘤复发和生长的机会了。那有人会问，切除了这些脑组织对病人生活有影响吗?答案是没有太大影响或者影响小，因为切除的这部分胶质瘤侵犯的脑组织是相对的功能“哑区”，所以切除后并没有太大的影响。
但是很多胶质瘤并不能按照脑叶切除的方式进行完全的切除，因为这些肿瘤是毗邻重要的功能区，这种胶质瘤就要在显微镜下沿着胶质瘤周围的水肿带进行分离，根据胶质瘤在颜色、质地、血供等与正常脑组织的细微差别来进行辨别和切除。也就是按照胶质瘤的解剖边界进行切除，这就特别需要外科医生的经验了，如果切除程度把握稍有不准，就可能出现切除过多而影响功能比如偏瘫。失语等，切除过少就会导致胶质瘤残留过多，容易复发。
还有一些胶质瘤已经完全侵犯到功能区或者本身就是生长在功能区里面，这种胶质瘤即使按照解剖边界进行切除也很容易造成病人的功能损伤，是胶质瘤当中较难切除干净的一种类型。在这种情况下，神经外科医生更要考虑到如何较大水平的保护功能，也就是按照肿瘤的功能边界进行切除。当胶质瘤切除到达相应的功能区后，即使还有肿瘤，也会停止切除，较大水平的保护病人的功能，剩余的肿瘤在手术后再根据病理结果采用放疗或者化疗来控制。
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