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脑胶质瘤基因检测项目

发布时间:2022-05-09 12:26
  脑胶质瘤基因检测可以通过检测分析找到所有致癌瘤和抑瘤基因的微小变异,从而认识肿瘤细胞发生、发展的机制,最终在肿瘤的诊断和治疗上获得突破并制定新型的肿瘤预防和治疗策略。运用新型分子分析方法,通过临床肿瘤基因的研究,筛选并发现不同患者对不种药物治疗存在个体差异的遗传指标,并通过检测这些指标向临床医师提供实验数据,对肿瘤化学治疗的敏感性、抗药性进行分析。
  运用最新进的基因芯片,可以检测出胶质瘤变异的特异性基因,来最终指导临床用药,实现个体化的治疗,延长患者预后。
  脑胶质瘤基因检测的结果判定
  1.IDH突变:异柠檬酸脱氢酶(isocitrate dehydrogenase,IDH)是三羧酸循环中的一种关键性限速酶,催化异柠檬酸氧化脱羧生成α-酮戊二酸及CO2,为细胞新陈代谢提供能量和生物合成的前体物质。IDH基因家族有三种异构酶(IDH1,IDH2和IDH3)。IDH1和IDH2的突变在原发性GBM中发生率很低(5.0%),但是在继发性GBM(84.6%)和WHO 2级、3级 胶质瘤星形细胞瘤(83.3%)、少突胶质细胞瘤(80.4%)、少突-星形细胞瘤(100%)、间变性星形细胞瘤(69.2%)、间变性少突-星形细胞瘤(86.1%)中发生率很高。
  2.MGMT启动子甲基化:MGMT定位于10q26,编码一种修复DNAO6-甲基鸟嘌呤的酶。其启动子包括含97个CG二核苷酸(CpG位点)的CpG岛。在正常组织中,MGMT的CpG位点一般都处在非甲基化状态。MGMT的CpG位点甲基化会导致染色体结构改变,从而阻止转录因子结合、导致MGMT基因的沉默。MGMT主要分布于细胞质,DNA损伤后才转移到细胞核。
  3.染色体1p/19q缺失:1p/19q联合性缺失是指1号染色体短臂和19号染色体长臂同时缺失,较早发现于少突胶质细胞瘤。1p/19q联合性缺失在少突胶质细胞瘤的发生率为80%-90%,在间变性少突胶质细胞瘤的发生率为50%-70%,在弥漫性星形细胞瘤发生率为15%,而在GBM发生率仅为5.0%。具有1p/19q联合性缺失的少突胶质细胞瘤患者通常伴随IDH基因突变及MGMT启动子甲基化和G-CPG岛甲基化(G-CIMP),但与TP53突变相互独立发生。
  4.EGFR扩增和EGFRvIII突变:表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor,EGFR)基因定位于染色体7p12,编码一种跨膜酪氨酸激酶受体。EGFR扩增在胶质瘤中发生率很高,并常伴随编码蛋白的过表达。间变性星形细胞瘤EGFR扩增的发生率为17%,GBM的发生率为50%~60%。FISH技术可以检测EGFR扩增,所以可作为判定肿瘤级别的备选指标。
  5.BRAF基因融合和点突变:BRAF原癌基因位于7q34,编码一种丝/苏氨酸特异性激酶,参与调控细胞内多种生物学过程,如细胞生长、分化和凋亡等。BRAF基因的串联重复导致了基因的融合,如KIAA1549-BRAF和FAM131B-BRAR(少见)。KIAA1549-BRAF融合在毛细胞型星形细胞瘤(PA;50%~70%)及多形性黄色瘤型星形细胞瘤(PXA;55.6%)中高发,而在其他胶质瘤或其他肿瘤中极为少见。KIAA1549-BRAF融合是一个重要的诊断标志物,由于PA也存在微血管增生,PXA在组织学上有时难以与GBM区分,如果检测有KIAA1549-BRAF融合则有助于PA和PXA与GBM的鉴别。
  6.Ki-67:Ki-67是一个395kD的抗原,其表达同细胞周期密切联系:Ki-67在G0和G1早期不表达,从G1期开始表达,在G2和S期表达量增加,至M期的表达量迅速下降。研究表明,Ki-67表达水平与胶质瘤患者的生存期及预后呈显著性负相关,Ki-67阳性表达率越高,肿瘤越容易复发,患者的生存时间越短。
  基因是具有遗传效应的DNA片段,它是决定生命健康的内在因素,基因的改变是引起肿瘤的根本原因。基因检测是通过肿瘤组织、血液、其他体液对DNA进行检测的技术,通过基因检测我们可以获得基因突变信息。最新的2016年世界卫生组织(WHO)中枢神经系统肿瘤指南,将分子病理引入了胶质瘤的诊断之中,现在的胶质瘤诊断报告由组织病理诊断和分子病理诊断两部分构成。组织病理可以明确病变是不是胶质瘤及其恶性程度。分子病理就是通过基因检测来明确肿瘤的基因突变特征,有助于肿瘤亚型分类、预后评估、放化疗敏感性的提示,从而指导放化疗、靶向等治疗方案的制定。总体来说基因检测能为胶质瘤的分型、治疗及预后评估提供重要的依据。
  目前胶质瘤检测基因主要包括IDH、1p19q、MGMT、TERT、EGFR、TP53、BRAF等。在分型方面,如果存在IDH突变+1p19q联合缺失,那么这个病人我们可以诊断为少突胶质细胞瘤,这种类型的胶质瘤对放化疗敏感,是弥漫胶质瘤预后最好的类型。
  预后评估方面,IDH有突变的患者多数比没有突变的患者预后好,MGMT启动子甲基化阳性的患者预后多数比阴性的预后可能要好,如果单纯TERT突变,是预后最不好的那种。
  在药物选择方面,MGMT启动子甲基化阳性的患者对替莫唑胺敏感。阴性的患者敏感性差。另外如果做了更多的基因检测项目,我们可以从中选择可能有效的靶向药物。比如肿瘤复发没有更好的办法的话,有BRAF突变我们可以试用维罗非尼治疗,VEGF高表达我们可以尝试抗血管生成的药物辅助治疗等,另外基因检测也是免疫治疗有效与否的评估方法之一。
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